植物科学与技术系创建于2014年，隶属于我院，开设“植物科学与技术”本科专业，该专业是为适应高等教育大众化背景下培育精英人才的需要，与由美国科学院院士、教育部“长江学者”等国内外一流学者组成的学校海峡联合研究院的基因组与生物技术、植物免疫等研究中心联合开设的专业。2020年“植物科学与技术”专业入选省级一流本科专业建设点。

植物科学与技术系拥有一支学术水平高、科研力量强、结构合理、以中青年教师为主的教学科研队伍，现有教学科研人员19人，其中有博士学位教师17人，博士生导师6人，国家杰出青年基金获得者1人次，国家优秀青年基金获得者1人次，国家和福建省百千万人才工程培养对象各1人次，福建省科技创新领军人物1人次。

植物科学与技术系拥有完善的教学和科研平台，为保障实验实践教学，培养学生的动手能力和科研能力，提供了优越了条件。此外，本系在科研创新、实践就业、文体活动等多方面对学生综合素质进行全方面拓展培训，历届学生都取得了优异成绩，各班集体获得不少荣誉奖章。

植物科学与技术系自建系起，本科毕业生就业率为100%，其中，40%以上学生通过推荐免试或自主考试继续深造学习，不少获得进入中科院、著名大学继续深造或申请海外留学等机会。就业学生有通过公务员选调系统或参加公务员统一考试进入各级公务员岗位、进入农业、生物类高新企业或自主创业等。